非洲联盟和平与安全理事会当地时间10月13日召开紧急会议商讨马达加斯加局势，并于会后发布公告。公告重申了非洲联盟对违宪更迭政府零容忍；强烈呼吁抗议者利用现有法律渠道解决任何合法诉求；强烈谴责一切形式的暴力和破坏财产行为；敦促马达加斯加武装部队恪守其宪法赋予的职责，避免干涉国家政治事务；强调马达加斯加政府需要采取“全政府-全社会”的方式，吸纳所有关键利益攸关方，包括妇女和青年，全面解决该国所面临多维度挑战的结构性根源；呼吁充分尊重所有公民的基本权利和自由；鼓励马达加斯加政府紧急组织包容各方的政治对话，作为就当前该国面临的社会经济和政治挑战达成协商一致和可持续解决方案的唯一可行途径。公告表示，非盟将紧急任命一位马达加斯加问题特使，并建立后续协调机制，同时建议立即向马达加斯加派遣一个高级别代表团，与相关利益攸关方接触，以期解决该国面临的挑战。